Все команды были разбиты на две корзины: 12 победителей групп и четыре лучших клуба, которые финишировали третьими на групповом этапе Лиги чемпионов УЕФА, получат статус сеяных.
Сеяные были сведены в парах с 12 обладателями вторых мест и оставшимися четырьмя клубами, которые финишировали третьими на групповом этапе Лиги чемпионов.
По итогам жеребьевки образовались следующие пары:
Виктория Плзень (Чехия) — Динамо
Загреб (Хорватия) Брюгге (Бельгия) — Зальцбург (Австрия) Рапид (Австрия) — Интер (Италия) Славия (Чехия) — Генк (Бельгия) Краснодар (Россия) — Байер (Германия) Цюрих (Швейцария) — Наполи (Италия) Мальме (Швеция) — Челси (Англия) Шахтер (Украина) — Айнтрахт (Германия) Селтик (Шотландия) — Валенсия (Испания) Ренн (Франция) — Бетис (Испания) Олимпиакос (Греция) — Динамо Киев (Украина) Севилья (Испания) — Лацио (Италия) Фенербахче (Турция) — Зенит (Россия) Спортинг (Португалия) — Вильярреал (Испания) БАТЭ (Белоруссия) — Арсенал (Англия) Галатасарай (Турция) — Бенфика (Португалия) Первые матчи состоятся 14 февраля, ответные — 21 февраля. Отметим, что сеяные команды ответный матч проводят дома.